由系友捐赠,部分已设立的基金有:
陈省身访问讲席教授基金、
华罗庚纪念奖学金、
林家翘奖学金、
熊庆来奖学金、
赵访熊奖学金、
萧树铁应用数学基金、
孙念增奖学金、
李欧奖学金、
郑宗柽奖学金、
魏文慧奖励学基金、
王家秀奖学金、
清华校友—数学系系友奖学金、
冯仲云奖学基金、
数学系贫困生助学金、
罗贤润奖学金、
清华校友—数学系韩迪奖学金,等。
曾进行捐赠的部分系友:林家翘(1937级),王家秀(1957级),魏文慧(1977级),罗建刚(1986级),秦晓(1993级),罗贤润(2004级),韩迪(2007级),等。